Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
PKP1Q13835 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PKP1Q13835 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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