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| NCOA4 | Q13772 | AC005154.2-201 | ENST00000438110 | 379 nt | BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
| NCOA4 | Q13772 | Z82210.1-201 | ENST00000440037 | 231 nt | BASIC | 5.11 | □□□□□ -1.59 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | MPHOSPH9-211 | ENST00000541076 | 6136 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| NCOA4 | Q13772 | FLG-AS1-205 | ENST00000445097 | 2857 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
| NCOA4 | Q13772 | CNGA1-203 | ENST00000420489 | 2746 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 5.1 | □□□□□ -1.59 | | |
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| NCOA4 | Q13772 | AC136601.2-201 | ENST00000604356 | 474 nt | BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| NCOA4 | Q13772 | UBE2Q2P6-201 | ENST00000612666 | 153 nt | BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| NCOA4 | Q13772 | LIMA1-214 | ENST00000552783 | 3612 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| NCOA4 | Q13772 | UBR1-201 | ENST00000290650 | 7761 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.59 | | |
| NCOA4 | Q13772 | ERC2-201 | ENST00000288221 | 6138 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.6 | | |
| NCOA4 | Q13772 | AC118273.1-201 | ENST00000525324 | 3006 nt | BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.6 | | |
| NCOA4 | Q13772 | AL136164.3-201 | ENST00000624429 | 3978 nt | BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.6 | | |
| NCOA4 | Q13772 | SPEF2-216 | ENST00000637569 | 7350 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.6 | | |
| NCOA4 | Q13772 | HSPA8P1-201 | ENST00000425843 | 1833 nt | BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.6 | | |
| NCOA4 | Q13772 | FANCD2-202 | ENST00000383807 | 5102 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.09 | □□□□□ -1.6 | | |
| NCOA4 | Q13772 | LRP6-201 | ENST00000261349 | 10020 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| NCOA4 | Q13772 | ZNF117-201 | ENST00000282869 | 9080 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| NCOA4 | Q13772 | DHX9P1-201 | ENST00000436565 | 3076 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |