Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ALCAMQ13740 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms