Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KRR1Q13601 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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