Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC7□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PKD2Q13563 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms