Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TCOF1Q13428 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
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