Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PDE3BQ13370 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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