Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATMQ13315 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATMQ13315 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATMQ13315 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATMQ13315 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.35
ATMQ13315 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATMQ13315 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATMQ13315 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATMQ13315 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ATMQ13315 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATMQ13315 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ATMQ13315 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATMQ13315 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATMQ13315 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ATMQ13315 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATMQ13315 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATMQ13315 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ATMQ13315 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
ATMQ13315 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ATMQ13315 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATMQ13315 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATMQ13315 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATMQ13315 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ATMQ13315 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATMQ13315 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
ATMQ13315 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATMQ13315 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATMQ13315 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATMQ13315 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ATMQ13315 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC0.33□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
ATMQ13315 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ATMQ13315 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
ATMQ13315 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATMQ13315 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATMQ13315 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATMQ13315 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
ATMQ13315 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
ATMQ13315 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATMQ13315 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATMQ13315 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
ATMQ13315 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
ATMQ13315 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ATMQ13315 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
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