Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
SEMA3BQ13214 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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