Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
NFIAQ12857 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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