Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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KCNMA1Q12791 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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KCNMA1Q12791 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
KCNMA1Q12791 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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KCNMA1Q12791 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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KCNMA1Q12791 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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KCNMA1Q12791 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
KCNMA1Q12791 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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