Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
FOXO1Q12778 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms