Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CHRNEQ04844 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms