Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CENPFP49454 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CENPFP49454 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
CENPFP49454 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPFP49454 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPFP49454 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPFP49454 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPFP49454 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPFP49454 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPFP49454 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPFP49454 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPFP49454 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPFP49454 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPFP49454 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
CENPFP49454 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPFP49454 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPFP49454 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPFP49454 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPFP49454 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPFP49454 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPFP49454 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPFP49454 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPFP49454 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPFP49454 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPFP49454 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPFP49454 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPFP49454 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPFP49454 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPFP49454 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
CENPFP49454 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPFP49454 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPFP49454 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPFP49454 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPFP49454 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPFP49454 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPFP49454 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPFP49454 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPFP49454 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPFP49454 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPFP49454 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPFP49454 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPFP49454 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPFP49454 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPFP49454 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPFP49454 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
CENPFP49454 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CENPFP49454 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CENPFP49454 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CENPFP49454 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CENPFP49454 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CENPFP49454 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
CENPFP49454 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CENPFP49454 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CENPFP49454 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
CENPFP49454 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CENPFP49454 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CENPFP49454 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CENPFP49454 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
CENPFP49454 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPFP49454 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPFP49454 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPFP49454 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPFP49454 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPFP49454 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPFP49454 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPFP49454 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPFP49454 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
CENPFP49454 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPFP49454 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPFP49454 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPFP49454 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPFP49454 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPFP49454 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPFP49454 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPFP49454 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPFP49454 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPFP49454 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPFP49454 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPFP49454 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC0.26□□□□□ -2.37
CENPFP49454 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPFP49454 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPFP49454 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPFP49454 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CENPFP49454 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms