Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PTPRGP23470 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PTPRGP23470 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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