Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms