Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
BRPF3Q9ULD4 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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