Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
EHD3Q9NZN3 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
EHD3Q9NZN3 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
EHD3Q9NZN3 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
EHD3Q9NZN3 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
EHD3Q9NZN3 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
EHD3Q9NZN3 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
EHD3Q9NZN3 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
EHD3Q9NZN3 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
EHD3Q9NZN3 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
EHD3Q9NZN3 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
EHD3Q9NZN3 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
EHD3Q9NZN3 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
EHD3Q9NZN3 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
EHD3Q9NZN3 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
EHD3Q9NZN3 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
EHD3Q9NZN3 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
EHD3Q9NZN3 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
EHD3Q9NZN3 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
EHD3Q9NZN3 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
EHD3Q9NZN3 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
EHD3Q9NZN3 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
EHD3Q9NZN3 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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