Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC1

VPS39, Vam6/Vps39-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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VPS39Q96JC1 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPS39Q96JC1 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPS39Q96JC1 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPS39Q96JC1 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
VPS39Q96JC1 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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VPS39Q96JC1 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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VPS39Q96JC1 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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VPS39Q96JC1 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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VPS39Q96JC1 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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VPS39Q96JC1 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
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VPS39Q96JC1 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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VPS39Q96JC1 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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VPS39Q96JC1 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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VPS39Q96JC1 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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