Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
BCANQ96GW7 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
BCANQ96GW7 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms