Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.97
CCDC47Q96A33 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CCDC47Q96A33 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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