Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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SGCAQ16586 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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SGCAQ16586 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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SGCAQ16586 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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SGCAQ16586 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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SGCAQ16586 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
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SGCAQ16586 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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SGCAQ16586 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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SGCAQ16586 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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SGCAQ16586 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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SGCAQ16586 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCAQ16586 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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