Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
E2F4Q16254 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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