Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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NPTX1Q15818 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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NPTX1Q15818 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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NPTX1Q15818 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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NPTX1Q15818 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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NPTX1Q15818 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NPTX1Q15818 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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