Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
HERC1Q15751 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC0.4□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
HERC1Q15751 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms