Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SKIV2LQ15477 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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