Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
DSC3Q14574 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms