Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
ATP1A4Q13733 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ATP1A4Q13733 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.2 ms