Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
BFSP2Q13515 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BFSP2Q13515 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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