Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
XRCC4Q13426 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
XRCC4Q13426 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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