Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ATMQ13315 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
ATMQ13315 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ATMQ13315 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ATMQ13315 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
ATMQ13315 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATMQ13315 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ATMQ13315 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATMQ13315 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATMQ13315 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATMQ13315 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATMQ13315 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
ATMQ13315 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATMQ13315 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC0.39□□□□□ -2.35
ATMQ13315 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ATMQ13315 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATMQ13315 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATMQ13315 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATMQ13315 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATMQ13315 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ATMQ13315 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATMQ13315 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ATMQ13315 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ATMQ13315 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATMQ13315 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATMQ13315 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ATMQ13315 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ATMQ13315 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ATMQ13315 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATMQ13315 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ATMQ13315 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
ATMQ13315 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
ATMQ13315 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATMQ13315 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATMQ13315 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ATMQ13315 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATMQ13315 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
ATMQ13315 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATMQ13315 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATMQ13315 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ATMQ13315 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATMQ13315 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATMQ13315 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
ATMQ13315 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATMQ13315 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATMQ13315 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ATMQ13315 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ATMQ13315 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATMQ13315 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATMQ13315 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
ATMQ13315 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
ATMQ13315 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
ATMQ13315 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATMQ13315 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
ATMQ13315 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
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