Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CALCOCO2Q13137 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms