Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
IFT88Q13099 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.8 ms