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| FOXF2 | Q12947 | CR392039.5-201 | ENST00000623201 | 510 nt | BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | CNTRL-201 | ENST00000238341 | 7431 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AK9-202 | ENST00000355283 | 2499 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | SGO1-AS1-203 | ENST00000455626 | 2041 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | ATXN3L-201 | ENST00000380622 | 2164 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.51 | □□□□□ -1.85 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | MACF1-231 | ENST00000564288 | 24828 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | TMEM251-201 | ENST00000283534 | 909 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | U2.17-201 | ENST00000611454 | 95 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | AC078938.1-201 | ENST00000620993 | 318 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | CCDC121-201 | ENST00000324364 | 2342 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | CEP170-215 | ENST00000481987 | 3031 nt | TSL 5 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | ADAM7-201 | ENST00000175238 | 3367 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RC3H2-203 | ENST00000373670 | 9248 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | ADGRL3-216 | ENST00000514157 | 4789 nt | TSL 5 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | DDX10P1-201 | ENST00000448545 | 1933 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | MTUS1-228 | ENST00000544260 | 3650 nt | TSL 2 BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AL136964.1-201 | ENST00000622038 | 2990 nt | BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | SUCNR1-201 | ENST00000362032 | 4181 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | GABRB2-203 | ENST00000393959 | 7191 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.5 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | LCOR-204 | ENST00000371103 | 10342 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | LINC01566-202 | ENST00000569242 | 2801 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC128685.1-201 | ENST00000490357 | 1834 nt | TSL 5 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | SENP7-202 | ENST00000348610 | 3272 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | MLH1-212 | ENST00000455445 | 2296 nt | TSL 2 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | ADGRG2-205 | ENST00000357991 | 4661 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | FOXP2-226 | ENST00000635638 | 2598 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | LINC00283-201 | ENST00000430111 | 1947 nt | TSL 5 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC103710.2-202 | ENST00000641454 | 2853 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNU6-450P-201 | ENST00000364654 | 107 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNU1-115P-201 | ENST00000365329 | 160 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | AC092809.3-201 | ENST00000415453 | 231 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | LINC01204-201 | ENST00000422047 | 639 nt | TSL 3 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | TTTY20-201 | ENST00000434487 | 259 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | PLCB1-IT1-201 | ENST00000441231 | 373 nt | TSL 3 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC073325.1-201 | ENST00000443714 | 542 nt | TSL 4 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
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| FOXF2 | Q12947 | PTP4A2-203 | ENST00000470404 | 575 nt | TSL 3 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RN7SL585P-201 | ENST00000470538 | 280 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC022493.2-201 | ENST00000506122 | 481 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC139718.1-201 | ENST00000508010 | 300 nt | TSL 5 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNU6-1143P-201 | ENST00000516125 | 104 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | RNU6-1332P-201 | ENST00000516666 | 104 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | CLEC7A-212 | ENST00000533022 | 625 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC126177.3-201 | ENST00000551839 | 688 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC023824.4-201 | ENST00000562572 | 476 nt | TSL 3 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | C18orf54-203 | ENST00000578138 | 776 nt | TSL 3 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | LIVAR-201 | ENST00000578633 | 384 nt | TSL 3 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC009271.1-202 | ENST00000588803 | 492 nt | TSL 3 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC010649.1-203 | ENST00000592230 | 454 nt | TSL 2 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AL589765.7-201 | ENST00000601684 | 629 nt | TSL 3 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC092447.9-201 | ENST00000603395 | 144 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC007619.2-201 | ENST00000605743 | 379 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC015813.4-201 | ENST00000610469 | 179 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC138627.2-201 | ENST00000624202 | 601 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | MPP6-209 | ENST00000625307 | 126 nt | TSL 5 BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | AC012442.3-202 | ENST00000636742 | 206 nt | BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |
| FOXF2 | Q12947 | F8-202 | ENST00000360256 | 9059 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.49 | □□□□□ -1.85 | | |