Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
FOXF2Q12947 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms