Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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SMARCB1Q12824 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SMARCB1Q12824 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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SMARCB1Q12824 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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SMARCB1Q12824 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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SMARCB1Q12824 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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SMARCB1Q12824 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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SMARCB1Q12824 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMARCB1Q12824 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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