Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NUP160Q12769 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
NUP160Q12769 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms