Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
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CENPFP49454 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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CENPFP49454 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
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CENPFP49454 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
CENPFP49454 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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CENPFP49454 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC0.36□□□□□ -2.35
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CENPFP49454 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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CENPFP49454 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
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CENPFP49454 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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CENPFP49454 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
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CENPFP49454 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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CENPFP49454 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CENPFP49454 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
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CENPFP49454 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CENPFP49454 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
CENPFP49454 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
CENPFP49454 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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