Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPREP23469 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPREP23469 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPREP23469 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPREP23469 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPREP23469 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPREP23469 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPREP23469 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPREP23469 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPREP23469 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPREP23469 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPREP23469 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPREP23469 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPREP23469 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPREP23469 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPREP23469 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPREP23469 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPREP23469 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPREP23469 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPREP23469 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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