Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PTPRBP23467 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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