Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
COPS7AQ9UBW8 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
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COPS7AQ9UBW8 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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COPS7AQ9UBW8 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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COPS7AQ9UBW8 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
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COPS7AQ9UBW8 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
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COPS7AQ9UBW8 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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COPS7AQ9UBW8 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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COPS7AQ9UBW8 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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COPS7AQ9UBW8 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.57□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
COPS7AQ9UBW8 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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