Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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HOXD1Q9GZZ0 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
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HOXD1Q9GZZ0 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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HOXD1Q9GZZ0 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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HOXD1Q9GZZ0 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HOXD1Q9GZZ0 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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HOXD1Q9GZZ0 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HOXD1Q9GZZ0 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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