Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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