Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ARXQ96QS3 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ARXQ96QS3 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ARXQ96QS3 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ARXQ96QS3 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ARXQ96QS3 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ARXQ96QS3 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ARXQ96QS3 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ARXQ96QS3 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ARXQ96QS3 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ARXQ96QS3 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ARXQ96QS3 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ARXQ96QS3 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ARXQ96QS3 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
ARXQ96QS3 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
ARXQ96QS3 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
ARXQ96QS3 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
ARXQ96QS3 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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