Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
TRERF1Q96PN7 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRERF1Q96PN7 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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