Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
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ZBED3Q96IU2 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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ZBED3Q96IU2 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ZBED3Q96IU2 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
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