Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
COL24A1Q17RW2 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms