Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC142Q17RM4 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
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