Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HIST2H2ACQ16777 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
HIST2H2ACQ16777 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms