Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
CLPPQ16740 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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