Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
HIF1AQ16665 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.5 ms